Branch Coverage

blib/lib/GenOO/Data/File/SAM/Cigar.pm

Criterion	Covered	Total	%
branch	40	46	86.9

line	true	false	branch
140	5	1	if ($self->cigar =~ /D/)
148	7	37	if ($identifier eq 'D') { }
	35	2	elsif ($identifier ne 'N' and $identifier ne 'P' and $identifier ne 'H') { }
172	6	25	if ($identifier eq 'D' or $identifier eq 'N' or $identifier eq 'P' or $identifier eq 'H') { }
	21	4	elsif ($identifier eq 'M' or $identifier eq '=' or $identifier eq 'X') { }
	4	0	elsif ($identifier eq 'I') { }
176	7	14	if ($mid_position_on_query < $count)
183	0	4	if ($mid_position_on_query < $count)
201	4	2	if ($self->cigar =~ /I/)
209	8	33	if ($identifier eq 'I') { }
	25	8	elsif ($identifier ne 'D' and $identifier ne 'N' and $identifier ne 'P' and $identifier ne 'H') { }
230	1	6	if ($self->cigar =~ /X/) { }
239	3	15	if ($identifier eq 'X') { }
	12	3	elsif ($identifier ne 'D' and $identifier ne 'N' and $identifier ne 'P' and $identifier ne 'H') { }
263	5	1	if ($self->cigar =~ /D/)
271	7	37	if ($identifier eq 'D') { }
	29	8	elsif ($identifier ne 'I' and $identifier ne 'P' and $identifier ne 'S' and $identifier ne 'H') { }
292	2	18	if ($self->cigar =~ /X/) { }
301	6	30	if ($identifier eq 'X') { }
	24	6	elsif ($identifier ne 'I' and $identifier ne 'P' and $identifier ne 'S' and $identifier ne 'H') { }
324	4	11	if (defined $self->strand and $self->strand == -1) { }
354	0	0	if ($identifier eq 'D' or $identifier eq 'N' or $identifier eq 'P' or $identifier eq 'H') { }
	0	0	elsif ($identifier eq 'M' or $identifier eq '=' or $identifier eq 'X') { }