File Coverage

blib/lib/Bio/MUST/Drivers/Hmmer.pm
Criterion Covered Total %
statement 15 15 100.0
branch n/a
condition n/a
subroutine 5 5 100.0
pod n/a
total 20 20 100.0


line stmt bran cond sub pod time code
1             package Bio::MUST::Drivers::Hmmer;
2             # ABSTRACT: Bio::MUST driver for running HMMER3
3             # CONTRIBUTOR: Arnaud DI FRANCO <arnaud.difranco@gmail.com>
4             # CONTRIBUTOR: Loic MEUNIER <loic.meunier@doct.uliege.be>
5             $Bio::MUST::Drivers::Hmmer::VERSION = '0.210160';
6 5     5   42 use strict;
  5         13  
  5         185  
7 5     5   33 use warnings;
  5         13  
  5         161  
8              
9 5     5   2450 use Bio::MUST::Drivers::Hmmer::Model;
  5         21  
  5         255  
10 5     5   3698 use Bio::MUST::Drivers::Hmmer::Model::Database;
  5         19  
  5         212  
11 5     5   3334 use Bio::MUST::Drivers::Hmmer::Model::Temporary;
  5         22  
  5         276  
12              
13             1;
14              
15             __END__
16              
17             =pod
18              
19             =head1 NAME
20              
21             Bio::MUST::Drivers::Hmmer - Bio::MUST driver for running HMMER3
22              
23             =head1 VERSION
24              
25             version 0.210160
26              
27             =head1 SYNOPSIS
28              
29             # TODO
30              
31             =head1 DESCRIPTION
32              
33             # TODO
34              
35             =head1 AUTHOR
36              
37             Denis BAURAIN <denis.baurain@uliege.be>
38              
39             =head1 CONTRIBUTORS
40              
41             =for stopwords Arnaud DI FRANCO Loic MEUNIER
42              
43             =over 4
44              
45             =item *
46              
47             Arnaud DI FRANCO <arnaud.difranco@gmail.com>
48              
49             =item *
50              
51             Loic MEUNIER <loic.meunier@doct.uliege.be>
52              
53             =back
54              
55             =head1 COPYRIGHT AND LICENSE
56              
57             This software is copyright (c) 2013 by University of Liege / Unit of Eukaryotic Phylogenomics / Denis BAURAIN.
58              
59             This is free software; you can redistribute it and/or modify it under
60             the same terms as the Perl 5 programming language system itself.
61              
62             =cut