File Coverage

blib/lib/Bio/FastParsers/Blast.pm
Criterion Covered Total %
statement 12 12 100.0
branch n/a
condition n/a
subroutine 4 4 100.0
pod n/a
total 16 16 100.0


line stmt bran cond sub pod time code
1             # ABSTRACT: Classes for parsing BLAST output
2             # CONTRIBUTOR: Aymeric NAOME <aymeric.naome@gmail.com>
3             $Bio::FastParsers::Blast::VERSION = '0.221230';
4             use strict;
5 7     7   40 use warnings;
  7         11  
  7         170  
6 7     7   30  
  7         13  
  7         144  
7             use Bio::FastParsers::Blast::Table;
8 7     7   2655 use Bio::FastParsers::Blast::Xml;
  7         22  
  7         267  
9 7     7   3425  
  7         24  
  7         307  
10             1;
11              
12              
13             =pod
14              
15             =head1 NAME
16              
17             Bio::FastParsers::Blast - Classes for parsing BLAST output
18              
19             =head1 VERSION
20              
21             version 0.221230
22              
23             =head1 SYNOPSIS
24              
25             # see Bio::FastParsers::Blast::Table
26             # see Bio::FastParsers::Blast::Xml
27              
28             =head1 DESCRIPTION
29              
30             Parsers for two BLAST output formats are available: tabular and XML.
31              
32             =head1 AUTHOR
33              
34             Denis BAURAIN <denis.baurain@uliege.be>
35              
36             =head1 CONTRIBUTOR
37              
38             =for stopwords Aymeric NAOME
39              
40             Aymeric NAOME <aymeric.naome@gmail.com>
41              
42             =head1 COPYRIGHT AND LICENSE
43              
44             This software is copyright (c) 2013 by University of Liege / Unit of Eukaryotic Phylogenomics / Denis BAURAIN.
45              
46             This is free software; you can redistribute it and/or modify it under
47             the same terms as the Perl 5 programming language system itself.
48              
49             =cut